MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium sp. MCS chromosome

Total Repeats: 155318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008146	CCGACC	2	12	27	38	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	108796982
2	NC_008146	CGT	2	6	64	69	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796982
3	NC_008146	GCC	2	6	92	97	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
4	NC_008146	ACGGTG	2	12	111	122	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108796982
5	NC_008146	GCA	2	6	142	147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
6	NC_008146	CTG	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796982
7	NC_008146	ATC	2	6	260	265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108796982
8	NC_008146	GCC	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
9	NC_008146	GAC	3	9	335	343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
10	NC_008146	CCG	3	9	344	352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
11	NC_008146	CGA	2	6	373	378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
12	NC_008146	CGA	2	6	382	387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
13	NC_008146	GCC	2	6	438	443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
14	NC_008146	GCC	2	6	458	463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
15	NC_008146	CCCGG	2	10	571	580	0 %	0 %	40 %	60 %	108796982
16	NC_008146	GTT	2	6	592	597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108796982
17	NC_008146	CTG	2	6	632	637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796982
18	NC_008146	TCA	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108796982
19	NC_008146	CGA	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
20	NC_008146	CGT	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796982
21	NC_008146	TGC	2	6	783	788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796982
22	NC_008146	CGA	2	6	793	798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
23	NC_008146	AAGG	2	8	818	825	50 %	0 %	50 %	0 %	108796982
24	NC_008146	TTC	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108796982
25	NC_008146	TCC	2	6	890	895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108796982
26	NC_008146	GCC	2	6	901	906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
27	NC_008146	GGA	2	6	925	930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108796982
28	NC_008146	GCC	2	6	976	981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
29	NC_008146	AAG	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108796982
30	NC_008146	CGA	2	6	1045	1050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
31	NC_008146	CAG	2	6	1069	1074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796982
32	NC_008146	CAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108796982
33	NC_008146	TCGC	2	8	1160	1167	0 %	25 %	25 %	50 %	108796982
34	NC_008146	TGC	2	6	1176	1181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796982
35	NC_008146	ATCTC	2	10	1185	1194	20 %	40 %	0 %	40 %	108796982
36	NC_008146	GCC	2	6	1235	1240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
37	NC_008146	CCG	2	6	1242	1247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
38	NC_008146	GAA	2	6	1414	1419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108796982
39	NC_008146	CGC	2	6	1442	1447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796982
40	NC_008146	CAC	2	6	1474	1479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108796982
41	NC_008146	GC	3	6	1492	1497	0 %	0 %	50 %	50 %	108796982
42	NC_008146	CGT	2	6	1509	1514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008146	GCC	2	6	1534	1539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008146	CGG	2	6	1549	1554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008146	A	6	6	1588	1593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008146	TCAC	2	8	1618	1625	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008146	CGT	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008146	CCGC	2	8	1722	1729	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_008146	GTCC	2	8	1732	1739	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008146	GCC	2	6	1743	1748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008146	TC	3	6	1831	1836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008146	TCT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008146	AC	3	6	1868	1873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008146	CGT	2	6	1891	1896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008146	CGAT	2	8	1919	1926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008146	GGT	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008146	GTC	2	6	1981	1986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008146	GTG	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796983
59	NC_008146	CGA	2	6	2082	2087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
60	NC_008146	CGG	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796983
61	NC_008146	TGC	2	6	2202	2207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796983
62	NC_008146	CGA	3	9	2215	2223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
63	NC_008146	TGT	2	6	2322	2327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108796983
64	NC_008146	GCC	2	6	2528	2533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796983
65	NC_008146	CGA	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
66	NC_008146	GGC	2	6	2602	2607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796983
67	NC_008146	ACCG	2	8	2609	2616	25 %	0 %	25 %	50 %	108796983
68	NC_008146	CGA	2	6	2649	2654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
69	NC_008146	GGC	2	6	2707	2712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796983
70	NC_008146	CTG	2	6	2783	2788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796983
71	NC_008146	GCA	2	6	2811	2816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
72	NC_008146	CTG	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796983
73	NC_008146	CGA	2	6	2886	2891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
74	NC_008146	TGG	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796983
75	NC_008146	CGA	2	6	2974	2979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
76	NC_008146	CCG	2	6	2994	2999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796983
77	NC_008146	CGA	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
78	NC_008146	GAG	2	6	3023	3028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108796983
79	NC_008146	ACG	2	6	3137	3142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
80	NC_008146	TCC	2	6	3159	3164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108796983
81	NC_008146	CGG	2	6	3168	3173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796983
82	NC_008146	CGA	2	6	3175	3180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796983
83	NC_008146	CGG	2	6	3187	3192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796983
84	NC_008146	GACCG	2	10	3264	3273	20 %	0 %	40 %	40 %	108796983
85	NC_008146	TGG	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796984
86	NC_008146	GTC	2	6	3370	3375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796984
87	NC_008146	TCGC	2	8	3412	3419	0 %	25 %	25 %	50 %	108796984
88	NC_008146	GTG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796984
89	NC_008146	GTCCG	2	10	3471	3480	0 %	20 %	40 %	40 %	108796984
90	NC_008146	CACG	2	8	3483	3490	25 %	0 %	25 %	50 %	108796984
91	NC_008146	TCGC	2	8	3502	3509	0 %	25 %	25 %	50 %	108796984
92	NC_008146	CGG	2	6	3543	3548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796984
93	NC_008146	CGCA	2	8	3575	3582	25 %	0 %	25 %	50 %	108796984
94	NC_008146	GT	3	6	3623	3628	0 %	50 %	50 %	0 %	108796984
95	NC_008146	CGG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796984
96	NC_008146	CGG	2	6	3672	3677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796984
97	NC_008146	CGA	2	6	3678	3683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796984
98	NC_008146	C	6	6	3726	3731	0 %	0 %	0 %	100 %	108796984
99	NC_008146	TGA	2	6	3821	3826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108796984
100	NC_008146	GTT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108796984
101	NC_008146	GCC	2	6	3856	3861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796984
102	NC_008146	GAG	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108796984
103	NC_008146	GGT	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796984
104	NC_008146	GCA	2	6	3933	3938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796984
105	NC_008146	GCT	2	6	3939	3944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796984
106	NC_008146	GGA	2	6	3960	3965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108796984
107	NC_008146	GAG	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108796984
108	NC_008146	GTGCCG	2	12	4048	4059	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	108796984
109	NC_008146	CG	3	6	4080	4085	0 %	0 %	50 %	50 %	108796984
110	NC_008146	AGG	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108796984
111	NC_008146	CCA	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108796984
112	NC_008146	CGG	2	6	4149	4154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796984
113	NC_008146	GAG	2	6	4228	4233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008146	GTT	2	6	4240	4245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108796985
115	NC_008146	GC	4	8	4283	4290	0 %	0 %	50 %	50 %	108796985
116	NC_008146	TCG	2	6	4323	4328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796985
117	NC_008146	CG	4	8	4437	4444	0 %	0 %	50 %	50 %	108796985
118	NC_008146	GTG	2	6	4445	4450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796985
119	NC_008146	GTG	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108796985
120	NC_008146	CAC	2	6	4501	4506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108796985
121	NC_008146	TGC	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796985
122	NC_008146	GCG	2	6	4617	4622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796985
123	NC_008146	CGC	3	9	4634	4642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
124	NC_008146	CGA	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796985
125	NC_008146	CCA	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108796985
126	NC_008146	CTG	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796985
127	NC_008146	CGC	2	6	4741	4746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
128	NC_008146	CGC	2	6	4810	4815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
129	NC_008146	GTT	2	6	4825	4830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108796985
130	NC_008146	CG	4	8	4837	4844	0 %	0 %	50 %	50 %	108796985
131	NC_008146	CAC	2	6	4856	4861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108796985
132	NC_008146	CGGC	2	8	4910	4917	0 %	0 %	50 %	50 %	108796985
133	NC_008146	TAC	2	6	4970	4975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108796985
134	NC_008146	GCC	2	6	4979	4984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
135	NC_008146	CCG	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
136	NC_008146	GAC	2	6	5057	5062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796985
137	NC_008146	GCCA	2	8	5102	5109	25 %	0 %	25 %	50 %	108796985
138	NC_008146	GCC	2	6	5147	5152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796985
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153	NC_008146	GCG	2	6	5620	5625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796986
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160	NC_008146	GATA	2	8	6051	6058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008146	CGC	3	9	6067	6075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_008146	CGG	2	6	6123	6128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_008146	GAG	2	6	6156	6161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_008146	ACG	2	6	9966	9971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
267	NC_008146	CTG	2	6	10016	10021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796988
268	NC_008146	CGGG	2	8	10032	10039	0 %	0 %	75 %	25 %	108796988
269	NC_008146	CGGT	2	8	10044	10051	0 %	25 %	50 %	25 %	108796988
270	NC_008146	CGA	2	6	10129	10134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
271	NC_008146	GAC	2	6	10138	10143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
272	NC_008146	CGC	2	6	10147	10152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796988
273	NC_008146	CCCA	2	8	10184	10191	25 %	0 %	0 %	75 %	108796988
274	NC_008146	GCG	2	6	10260	10265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796988
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277	NC_008146	TCA	2	6	10347	10352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108796988
278	NC_008146	CCAGT	2	10	10411	10420	20 %	20 %	20 %	40 %	108796988
279	NC_008146	TCG	3	9	10440	10448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796988
280	NC_008146	AAC	2	6	10484	10489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108796988
281	NC_008146	TCG	2	6	10542	10547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796988
282	NC_008146	GAT	2	6	10579	10584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108796988
283	NC_008146	CTA	2	6	10588	10593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108796988
284	NC_008146	GCG	2	6	10621	10626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796988
285	NC_008146	CGA	2	6	10702	10707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
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287	NC_008146	GGCC	2	8	10753	10760	0 %	0 %	50 %	50 %	108796988
288	NC_008146	GCT	2	6	10768	10773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796988
289	NC_008146	CGA	2	6	10780	10785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
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295	NC_008146	CGTG	2	8	10933	10940	0 %	25 %	50 %	25 %	108796988
296	NC_008146	CGA	2	6	10972	10977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
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299	NC_008146	CGT	3	9	11044	11052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796988
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301	NC_008146	GCG	2	6	11115	11120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796988
302	NC_008146	GAC	2	6	11153	11158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796988
303	NC_008146	CTT	2	6	11170	11175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108796988
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322	NC_008146	TCGA	2	8	11705	11712	25 %	25 %	25 %	25 %	108796988
323	NC_008146	CCG	2	6	11767	11772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108796988
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331	NC_008146	GAG	2	6	12013	12018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
332	NC_008146	CG	3	6	12053	12058	0 %	0 %	50 %	50 %	108796989
333	NC_008146	AGG	2	6	12072	12077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108796989
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359	NC_008146	TCC	2	6	13052	13057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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362	NC_008146	GCG	2	6	13359	13364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796990
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377	NC_008146	TCG	2	6	13938	13943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108796991
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380	NC_008146	GCG	2	6	14058	14063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108796991
381	NC_008146	CGA	2	6	14107	14112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796991
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383	NC_008146	GCCGG	2	10	14165	14174	0 %	0 %	60 %	40 %	108796991
384	NC_008146	TTC	2	6	14192	14197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108796991
385	NC_008146	C	6	6	14214	14219	0 %	0 %	0 %	100 %	108796991
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389	NC_008146	CGACCG	2	12	14295	14306	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108796991
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391	NC_008146	CGA	2	6	14364	14369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
392	NC_008146	GCCG	2	8	14394	14401	0 %	0 %	50 %	50 %	108796992
393	NC_008146	GCCT	2	8	14551	14558	0 %	25 %	25 %	50 %	108796992
394	NC_008146	CCA	2	6	14574	14579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108796992
395	NC_008146	GAC	2	6	14703	14708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796992
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397	NC_008146	GAAT	2	8	14922	14929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
398	NC_008146	GCA	2	6	15040	15045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796993
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401	NC_008146	CGA	2	6	15133	15138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108796993
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